Programme Porte des Etoiles : 2nde partieDes scientifiques étudient l'avant-poste en antarctique. Le Dr Beckett rare terriens à posséder le gênes des anciens capable des faire fonctionner la technologies des anciens peinait à faire fonctionner les appareils jusqu'a ce que le Major John Sheppard active par mégarde un de ces appareils et localise la cité perdues des anciens : Atlantis.
Ils décident d'y envoyer une équipe internationale composée des meileurs scientifiques,techniciens et soldat. Le Major Sheppard sujet possédant le gênes le plus pure des anciens et très bon pilote fait partis du voyage.
L'adresse comprend 8 symboles au lieu de 7, le point d'origine un relais et les quatre autres pour définir la destination. Cela demandant beaucoup d'énergie le ZPM (voir p. 8)appareil qui fournis l'énergie de l'arme de l'avant-poste est utilisée et vider laissant la terre sans défense.
En arrivant la bas il découvre une cité engloutie à laquelle les boucliers retenant l'eau vont bientôt lacher laissant l'eau détruire la cité. Mais quand le bouclier lache la cité remonte d'elle même à la surface.
Croyant que la cité allait être engloutie, des soldats sont partient sur un des mondes de la galaxie de Pégase pour trouver un ZPM ou une terre d'acceuil pour évacuer Atlantis, il arrive sur Athos ou il rencontre Teyla qui leur explique qu'un dangereux ennemis les Wraiths sèment la terreur dans leur galaxie. C'est alors qu'lis se font attaquer par ces même ennemis qui capturent beaucoup des soldat dont le Colonel Summers, el plus haut gradé de l'expédition. Le major Sheppard évacue tous les Athosiens sur Atlantis. Et décide de partirent sauver les soldat grâce à un vaisseaux des anciens il parvient a passer par la porte en orbite et est contraint de tuer la gardienne des wraith en hibernation. Les wraiths se réveille et rassemble leurs vaisseau dans le but de détruire la dernière cité qui ose les défier ... Atlantis.
Dans un dernier espoir Atlantis parvient à contacter la Terre en les avertissant de l'invasion imminente d'Atlantis. Avec l'aide des Asgard les Terriens construisent un immense vaisseau, le plus puissants jamais construit, le Dédale et embarquent vers Atlantis. Il arrive peu après le début de la bataille.
Malgré le déploiement de grands moyens les wraith prennent pied dans la cité mais grâce a l'EPPZ trouvé peu de temps avant par SG1, la cité réalimenter, les boucliers s'active. Le Dédale entame alors les manoeuvres de combat et remporte la victoire. Atlantis peut à présent rallier la Terre.